六神丸有多种组成，现在通行的是雷允上方。由犀牛黄、粗珍珠、蟾酥、朱砂、雄黄等六药组成，由于传说此方是六路神仙所传，所以称为"六神丸"。组成六神丸的药物性多属寒凉，具有清热解毒，消肿止痛的功效，故可治疗由于热毒引发的咽喉肿痛、口舌糜烂、上火牙痛等症。近年来又发现六神丸还可用于其它表现为热毒炽盛症状的疾病，如带状疱疹(外用)、流行性腮腺炎(外用)、扁桃体炎、阴囊湿疹(外用)等。

如果平常有身体虚寒，咽痛等症如果不属于热症者，不宜运用。还要注意此药不可过量服用，以免引发过敏反应;也不可长期服用，因其中雄黄是砷化物，久服则易导致慢性砷中毒。